A Escola Municipal São Francisco de Assis nasceu do ideal de um morador do bairro de Nazaré, o senhor Osvaldo Cavalcante. No início da década de cinquenta não havia muitas escolas na cidade do Natal, principalmente na periferia, fato que o incomodava muito. Com intenção de oferecer um futuro para os jovens que ali moravam afastando-os da ociosidade, criou, em sua residência, uma escola que chamou de Escola São Francisco de Assis, nome escolhido por ser devoto do santo.
Por décadas manteve-a sozinho, contando com o auxílio de sua filha Ledy Cavalcante. Em meados da década de setenta a Prefeitura do Natal assumiu a manutenção da instituição mas manteve o nome escolhido por seu Osvaldo. No ano de mil novecentos e noventa mudou de endereço passando a funcionar em prédio próprio situado a Av. Miguel Castro, nº 126, no bairro de Nazaré.
Em funcionamento há mais de cinquenta anos recebe crianças na faixa etária entre cinco a dez anos, atendendo da Educação Infantil ao 5º ano do Ensino Fundamental, contando com seiscentos e cinquenta alunos aproximadamente.
Atualmente conta com uma equipe gestora formada pela Diretora a Profª Maria da Natividade, a Vice-Diretora a Profª Roselane Praxedes, os Coordenadores Pedagógicos Cleucy Lima, Elba Ferreira, Edna Maria Gomes e Manuel Medeiros, a Inspetora Escolar Edna Maranhão e o Suporte Financeiro Maria José Xavier. O quadro de professores é formado por educadores graduados a maioria com pós-graduação em educação.